Le SEFRI est compétent pour l'évaluation des requêtes PRN en matière de politique de la recherche et de politique universitaire.
Le Département fédéral de l'économie, de la formation et de la recherche (DEFR) décide en dernière instance des PRN à mettre en oeuvre et leur attribue à chacun une enveloppe financière. Conformément à l'ordonnance du DEFR, les principaux critères suivants de durabilité structurelle sont appliqués lors de l'examen:
- a. soutien au domaine de recherche respectif dans la planification stratégique de l'institution hôte;
- b. répartition des tâches et coordination dans le domaine des hautes écoles;
- c. insertion dans la répartition globale régionale et nationale des centres de compétences et des pôles de recherches en fonction des objectifs du programme fédéral "Pôles de recherche nationaux";
- d. concordance avec les buts de la politique de recherche de la Confédération;
- e. intégration au sein de la coopération internationale scientifique et des efforts de coopération de la Suisse au plan institutionnel.