Les bénéficiaires de l'overhead décident de manière autonome de l'utilisation de ces fonds. L'utilisation doit être en relation avec le but de l'overhead, qui consiste à couvrir une partie des frais de recherche indirects. Les hautes écoles ont des approches différentes quant à l'utilisation de l'overhead. C’est l'institution concernée qui décide dans quelle mesure les chercheurs, dont l’approbation des projets est à l'origine des subsides overhead, doivent en profiter directement.